이 게임은 1993년을 배경으로 하며, 오컬트 동아리 소속 학생 5명이 톨루카 호수의 미스터리를 풀기 위해 사일런트 힐을 방문하면서 시작됩니다. 75년 전, '리틀 바로네스(Little Baroness)'라는 이름의 배가 승무원과 승객 전원을 태운 채 호수에서 실종되었고, 시신조차 발견되지 않았다는 사실이 알려져 있습니다. 도착 다음 날 아침, 주인공인 에릭과 티나는 동아리 회원 중 한 명이 부상을 입고 나머지는 실종되었으며, 마을 전체가 괴물들로 들끓고 있다는 사실을 알게 됩니다.
Silent Hill: The Arcade는 The House of the Dead 시리즈와 유사한 레일 슈터 게임으로, 화면 밖으로 총구를 돌려 재장전하는 방식과 무기 파워업 시스템을 갖추고 있습니다. 플레이어는 브룩헤이븐 병원, 사일런트 힐 역사 협회, 레이크사이드 유원지 등 익숙하거나 새로운 장소들을 누비며 떼를 지어 몰려오는 괴물들을 물리치고, 이 재앙의 핵심인 리틀 바로네스 호에 탑승했던 어린 소녀를 찾아 나아가게 됩니다. 이 게임은 총 4개의 엔딩을 지원하며, 그중 하나는 전통적인 'UFO' 엔딩입니다.