Creatures 2: Torture Trouble은 전작 Creatures의 사건 이후를 다룹니다. 전작에서 악마들을 물리치고 동료 퍼지 워지(Fuzzy Wuzzies)들을 구출한 클라이드 래드클리프(Clyde Radcliff)는 '퍼제트(Fuzzette)' 보니와 함께 정착하여 9명의 자녀를 두었습니다. 하지만 불행히도 일부 악마들이 탈출하여 클라이드의 자녀들과 마을의 모든 주민을 납치하며 복수를 감행합니다. 클라이드는 이들을 모두 구출하고 악마들을 소탕해야 합니다. 이 게임은 전작의 스크롤 방식 레벨을 버렸지만, 클라이드가 단일 화면 레벨에서 사물들을 조작하여 가족과 친구들을 구출해야 하는 고문실(torture chambers) 시스템은 그대로 유지했습니다. 클라이드가 사용하는 다양한 공격 모드는 전작처럼 마녀에게서 얻는 방식이 아니라, 고문실 레벨에서 물약을 획득하여 업그레이드하는 방식으로 변경되었습니다. 또한, 대부분의 레벨에서 보너스 코인을 획득할 수 있으며, 5개를 모으면 목숨이 하나 추가됩니다. 게임은 총 세 개의 섬으로 구성되어 있습니다. 각 고문실 레벨이 끝나면 퍼지 워지들이 높은 절벽에서 떨어지는 막간 구간이 이어집니다. 여기서 클라이드와 마지막으로 구출한 퍼지는 다른 퍼지들을 튕겨 올려 안전한 반대편 절벽으로 옮겨야 하며, 이때 퍼지가 날아다니는 악마의 손아귀에 들어가지 않도록 주의해야 합니다. 이 막간 구간 동안 플레이어는 제한 시간 내에 일정 수 이상의 퍼지를 안전하게 옮겨야 합니다. 또 다른 고문실 레벨과 막간 구간을 거친 후, 클라이드는 3마리의 악마 가족에게 붙잡히게 됩니다. 클라이드는 벌레를 차서 ACME 진공청소기 속으로 빨려 들어가게 한 뒤 악마들을 향해 발사하여 이들을 차례로 물리쳐야 합니다. 이 과정에서 플레이어는 악마들이 떨어뜨리는 물체들을 피해야 합니다. 악마들은 크기와 힘이 커지는 순서대로 등장합니다.
세 번째 섬을 제외한 모든 섬의 마지막 레벨에서 클라이드는 퍼지들을 현재 섬에서 다음 섬으로 이동시켜야 합니다. 클라이드는 스쿠버 장비를 갖추고 있어 물속으로 들어갈 수 있지만, 퍼지나 클라이드를 공격할 수 있는 다양한 악마들을 피하며 다른 퍼지들을 물 위로 운반해야 합니다. 중간중간 퍼지들을 내려놓을 수 있는 섬들이 거점 역할을 합니다.